Najznámejšou jaskyňou Veľkej Fatry je kvapľová Harmanecká jaskyňa. Ako Národná prírodná pamiatka patrí k najvýznamnejším jaskyniam na Slovensku, a to hlavne pre svoj výskyt netopierov.
Jaskyňa sa nachádza pri obci Harmanec, na území Harmaneckého krasu a vedie k nej serpentínový náučný chodník.
Jaskyňa je charakteristická i bielymi pagodami, sintrovými jazierkami, nástennými vodopádmi s ružovkastými záclonovitými závesmi vo Vysokom gotickom dóme a Kamennou vázou v Dóme pagod.
